MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017784	CCA	2	6	414	419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017784	GTAA	2	8	429	436	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017784	TTC	2	6	635	640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017784	T	6	6	650	655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017784	CTTT	2	8	656	663	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017784	TATT	2	8	681	688	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017784	TA	3	6	710	715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017784	A	6	6	736	741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017784	TAA	2	6	762	767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017784	ATT	2	6	780	785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017784	CAA	2	6	787	792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017784	CCT	2	6	1972	1977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_017784	T	7	7	1986	1992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017784	A	6	6	2020	2025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017784	ACATA	2	10	2034	2043	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017784	TAC	2	6	2049	2054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017784	A	6	6	2059	2064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017784	CT	3	6	2080	2085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017784	CCT	2	6	3241	3246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_017784	T	7	7	3255	3261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017784	A	6	6	3281	3286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017784	TA	3	6	3304	3309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017784	A	6	6	3332	3337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017784	CT	3	6	3351	3356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017784	AATA	2	8	3373	3380	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017784	GAA	2	6	3383	3388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017784	AAAGT	2	10	3411	3420	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017784	ATTT	2	8	3425	3432	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017784	CTA	2	6	3446	3451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017784	CAT	2	6	3467	3472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017784	ATTC	2	8	4303	4310	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017784	CTTA	2	8	4317	4324	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017784	N	473	473	4332	4804	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017784	TCT	2	6	4821	4826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017784	TCT	2	6	4835	4840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017784	AT	3	6	5870	5875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017784	A	6	6	5880	5885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017784	TTAA	2	8	5892	5899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017784	T	6	6	5940	5945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017784	TTC	2	6	7037	7042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017784	TC	3	6	7048	7053	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017784	ATA	2	6	7097	7102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017784	ATA	2	6	7110	7115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017784	AAAT	2	8	7122	7129	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017784	ATT	2	6	7139	7144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017784	TAT	2	6	7190	7195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017784	A	7	7	7203	7209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017784	TTACTA	2	12	7217	7228	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017784	AAC	2	6	7351	7356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017784	ACTT	2	8	7380	7387	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017784	AAAT	2	8	7443	7450	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017784	AAAACA	2	12	7483	7494	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017784	N	515	515	7539	8053	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017784	AAAT	2	8	8074	8081	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017784	AAAACA	2	12	8114	8125	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017784	TAA	2	6	8219	8224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017784	ATA	2	6	8233	8238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017784	AT	3	6	8258	8263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017784	TA	3	6	8267	8272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017784	TAAAA	2	10	8281	8290	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017784	TTTA	2	8	8332	8339	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017784	TTC	2	6	8342	8347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017784	TAT	2	6	8352	8357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017784	CTTC	2	8	8921	8928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017784	CTT	2	6	8935	8940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017784	CCTT	2	8	8949	8956	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017784	CTT	2	6	8962	8967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017784	TC	4	8	8985	8992	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017784	TC	4	8	8999	9006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017784	CTCTT	2	10	9021	9030	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_017784	TCC	2	6	9045	9050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017784	CCT	2	6	9065	9070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_017784	TTAT	2	8	9078	9085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017784	CA	3	6	9106	9111	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017784	A	6	6	9111	9116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017784	CAA	2	6	9119	9124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017784	ATT	2	6	9144	9149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017784	TA	3	6	9150	9155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017784	A	8	8	9176	9183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.